Helal gıda da belgelendirme denetimi, firma yapısını ve detaylı bir şekilde ortaya koymak amacıyla belge ve saha denetimi olarak 2 ayrılır. Denetimin amacı, firmanın yönetim ve ürün işlemle ilgili helal gıda markalarında denetim süreci için bilgi toplamaktır. GİMES de konu hakkında eğitimli, uzman, tarafsız, baş denetçi ve denetçilerle çalışmaktadır. Görevlendirilen denetçilerin tarafsız olmaları ve geçmiş 2 yıl suresince denetlenecek yerle ilgili ilişkilerinin olmaması istenir. Denetlenecek olan firma isterse GİMDES’in denetçileri hakkında bilgi edinebilir.Firma bilgilerinin üçüncü kişilere aktarılmayacağı için “Gizlilik anlaşması” yapılır. 
Denetimlerin genel durumu
İlk önce denetim, genel hatlarıyla ilgili olarak denetimin öncesin de firma yetkililerine bildirilir. Denetimin detaylı olarak planlanması denetime gelen baş denetçinin tarafından açılış toplantısında aldığı bilgiler ile gerçekleşir. Firma, helal gıda markalarında denetim süreci ile ilgili bilgi almak isterse GİMDES yetkililerinden bilgi edinebilir. Denetim de belge kontrolleri yapılırken baş denetçi istediği dokümanların kopyasını alma hakkına sahiptir. Denetim sonunda baş denetçi tarafından yazılı rapor hazırlanılarak kapanış toplantısında firmaya sunulacaktır. Uygunsuzlukların giderilmesi için yapılması gereken düzeltici faaliyetler kapanış toplantısında görüşülür. Baş denetçi tarafından denetim sonrasında rapor doğrultusunda GİMDES heyeti sertifika verilip verilmeyeceğine karar verir. Heyet kararı ile sertifika, ilk tescil için 1 yıl geçerli olmak şartıyla onaylanır.Tekrar belge için süre 2 yıldır.
